Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms