Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE3CQ15386 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms