Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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