Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PKP1Q13835 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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PKP1Q13835 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKP1Q13835 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKP1Q13835 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKP1Q13835 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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PKP1Q13835 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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