Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms