Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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