Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PEX6Q13608 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PEX6Q13608 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PEX6Q13608 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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