Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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