Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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