Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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