Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.8 ms