Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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