Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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