Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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