Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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