Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
TRAF2Q12933 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF2Q12933 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms