Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NUP160Q12769 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms