Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms