Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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