Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
J3KRW8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
J3KRW8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
J3KRW8 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
J3KRW8 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
J3KRW8 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
J3KRW8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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