Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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