Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms