Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms