Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1068.3 ms