Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RRN3P1Q2M238 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3P1Q2M238 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms