Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRNQ16849 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRNQ16849 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRNQ16849 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PTPRNQ16849 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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PTPRNQ16849 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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