Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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