Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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