Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDK4Q16654 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PDK4Q16654 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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