Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TNXAQ16473 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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