Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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HERC1Q15751 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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HERC1Q15751 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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