Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms