Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TTF1Q15361 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TTF1Q15361 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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