Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB35Q15286 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms