Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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RAB39AQ14964 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB39AQ14964 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB39AQ14964 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB39AQ14964 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB39AQ14964 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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RAB39AQ14964 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RAB39AQ14964 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RAB39AQ14964 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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RAB39AQ14964 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB39AQ14964 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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RAB39AQ14964 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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RAB39AQ14964 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB39AQ14964 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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