Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms