Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms