Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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