Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms