Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms