Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TCIRG1Q13488 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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