Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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