Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MSLNQ13421 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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