Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PMS2P3Q13401 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PMS2P3Q13401 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PMS2P3Q13401 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PMS2P3Q13401 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PMS2P3Q13401 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PMS2P3Q13401 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PMS2P3Q13401 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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