Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NME3Q13232 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NME3Q13232 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NME3Q13232 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NME3Q13232 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NME3Q13232 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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