Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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