Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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PTP4A2Q12974 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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PTP4A2Q12974 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTP4A2Q12974 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTP4A2Q12974 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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