Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX4Q12846 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX4Q12846 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX4Q12846 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX4Q12846 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
STX4Q12846 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms