Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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