Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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